遠(yuǎn)古之神"大蛇"企圖滅世,因而產(chǎn)生了兩位救世巫女。兩位巫女經(jīng)歷不停地輪回轉(zhuǎn)世,相遇后以兩人之力封印住大蛇。而原本只是普通高中生、卻為"日之巫女“轉(zhuǎn)世的來棲川姬子以及"月之巫女"的轉(zhuǎn)世姬宮千歌音,為了再次封印大蛇,不得不想辦法召喚傳說中的劍神"天之叢云"。大蛇的八個仆人們(人性的八個黑暗面)為阻止兩人召喚天之叢云,而屢次對她們發(fā)動襲擊;這時,原本應(yīng)該是"大蛇"之一、排名順序七的大神相馬因為暗戀姬子已久,而背叛了大蛇的意志,屢次地拯救她們,但卻又引發(fā)了另一場風(fēng)波。不停輪回的兩人,無法分離的命運,這是身為“神無月之巫女”的命運。